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2024
Iida, T., Ando, J., Yoshimura, M., Makino, A., Nakano, M., Kogo, Y., Shinoda, H., Toyoda, M., Noda, T., & *Watanabe, R.“Portable wide-field femtoliter-chamber imaging system for point-of-care digital bioanalysis”
iScience (2024) 110868
*Ando, J., Murai, K., Mori, M., Michiyuki, T., Iida, T., Makino, A., Shinoda, H., & *Watanabe, R.
“Exploring fluoropolymers for fabrication of femtoliter chamber arrays used in digital bioanalysis”
Sci Rep (2024) 14, 11442
Sakamoto, S., Hiraide, H., Minoda, M., Iwakura, N., Suzuki, M., Ando, J., Takahashi, C., Takahashi, I., Murai, K., Kagami, Y., Mizuno, T., Koike, T., Nara, S., Morizane, C., Hijioka, S., Kashiro, A., Honda, K., Watanabe, R., *Urano, Y & *Komatsu, T.
“Identification of activity-based biomarkers for early-stage pancreatic tumors in blood using single-molecule enzyme activity screening”
Cell Rep Methods (2024) 100688
2023
Ukegawa, T., *Komatsu, T., Minoda, M., Matsumoto, T., Iwasaka, T., Mizuno, T., Tachibana, R., Sakamoto, S., Hanaoka, K., Kusuhara, H., Honda, K., Watanabe, R., & *Urano, Y.“Thioester-Based Coupled Fluorogenic Assays in Microdevice for the Detection of Single-Molecule Enzyme Activities of Esterases with Specified Substrate Recognition”
Adv Sci (2023) e2306559
Ando, J., & *Watanabe, R.
“Toward versatile digital bioanalysis”
Biomicrofluidics (2023) 17, 061303
Iida, T., Shinoda, H., & *Watanabe, R.
“SATORI: Amplification-free digital RNA detection method for the diagnosis of viral infections”
Biophys Physicobiol (2023) e200031
Ueda, T., *Shinoda, H., Makino, A., Yoshimura, M., Iida, T., & *Watanabe, R.
“Purification/Amplification-Free RNA Detection Platform for Rapid and Multiplex Diagnosis of Plant Viral Infections”
Anal Chem (2023) 95, 9680-9686
Kastian, RF., Baba, K., Kaewkascholkul, N., Sasaki, H., Watanabe, R., Toriyama, M., & *Inagaki, N.
“Dephosphorylation of neural wiring protein shootin1 by PP1 phosphatase regulates netrin-1-induced axon guidance”
J Biol Chem (2023) 299, 1046687
Nagano, N., Ichihashi, Y., Komatsu, T., Matsuzaki, H., Hata, K., Watanabe, T., Misawa, Y., Suzuki, M., Sakamoto, S., Kagami, Y., Kashiro, A., Takeuchi, K., Kanemitsu, Y., Ochiai, H., Watanabe, R., Honda, K., & *Urano, Y.
“Development of fluorogenic substrates for colorectal tumor-related neuropeptidases for activity-based diagnosis”
Chem Sci (2023) 14, 4495-4499
Iida, T., Ando, J., Shinoda, H., Makino, A., Yoshimura, M., Murai, K., Mori, M., Takaeuchi, H., Noda, T., Nishimasu, H., & *Watanabe, R.
“Compact wide-field femtoliter-chamber imaging system for high-speed and accurate digital bioanalysis”
Lab Chip (2023) 23, 684-691
2022
Shinoda, H., Iida, T., Makino, A., Yoshimura, M., Ishikawa, J., Ando, J., Murai, K., Sugiyama, K., Muramoto, Y., Nakano, M., Kiga, K., Cui, L., Nureki, O., Takaeuchi, H., Noda, T., *Nishimasu, H., & *Watanabe, R.“Automated amplification-free digital RNA detection platform for rapid and sensitive SARS-CoV-2 diagnosis”
Commun Biol (2022) 5, 473
2021
Shinoda, H., Taguchi, Y., Nakagawa, R., Makino, A., Okazaki, S., Nakano, M., Muramoto, Y., Takahashi, C., Takahashi, I., Ando, J., Noda, T., *Nureki, O., *Nishimasu, H., & *Watanabe, R.“Amplification-free RNA detection with CRISPR-Cas13”
Commun Biol (2021) 4, 476
2020
Soga, N., Ota, A., Nakajima, K., Watanabe, R., Ueno, H., & *Noji, H.“Monodisperse Liposomes with Femtoliter Volume Enable Quantitative Digital Bioassays of Membrane Transporters and Cell-Free Gene Expression”
ACS Nano (2020) 14, 11700-11711
Sakamoto, S., *Komatsu, T., *Watanabe, R., Zhang, Y., Inoue, T., Kawaguchi, M., Nakagawa, H., Ueno, T., Okusaka, T., Honda, K., *Noji, H., & *Urano, Y.
“Multiplexed single-molecule enzyme activity analysis for counting disease-related proteins inbiological samples”
Sci Adv (2020) 6, eaay0888
2018
*Watanabe, R., Komatsu, T., Sakamoto, S., Urano, Y., & *Noji, H.“High-throughput single-molecule bioassay using micro-reactor arrays with a concentration gradient of target molecules”
Lab Chip (2018) 18, 2849-2853
Baba, K., Yoshida, W., Toriyama, M., Shimada, T., Manning, C., Saito, M., Kohno, K., Trimmer, J., Watanabe, R., & *Inagaki, N.
“Gradient-reading and mechano-effector machinery for netrin-1–induced axon guidance”
eLife (2018) 7, e34593
Moriizumi, Y., *Tabata, KV, Watanabe, R., Doura, T., Kamiya, M., Urano, Y., & *Noji, H.
“Hybrid cell reactor system from Escherichia coli protoplast cells and arrayed lipid bilayer chamber device”
Sci Rep (2018) 8, 11757
*Watanabe, R., Sakuragi, T., *Noji, H., & *Nagata, S.
“Single molecule analysis of phospholipid scrambling by TMEM16F”
Proc Natl Acad Sci USA (2018b) 115, 3066-3071
Abe, K., Katsuno, H., Toriyama, M., Baba, K., Mori, T., Hakoshima, T., Kanemura, Y., Watanabe, R., & *Inagaki, N.
“Grip and slip of L1-CAM on adhesive substrates direct growth cone haptotaxis”
Proc Natl Acad Sci USA (2018a) 115, 2764-2769
*Watanabe, R., Soga, N., Ohdate, S., & *Noji, H.
“Single molecule analysis of membrane transporter activity by using a microsystem”
Methods Mol Biol (2018) 1700, 321-330
*Watanabe, R., Genda, M., Kato-Yamada, Y., & *Noji, H.
“Essential role of the epsilon subunit for reversible chemo-mechanical coupling in F1-ATPase”
Biophys J (2018) 114, 178-187
Tamiya, Y., Watanabe, R., Noji, H., *Li, C., & *Komatsuzaki, T.
“Effects of non-equilibrium angle fluctuation on F1-ATPase kinetics induced by temperature increase”
Phys Chem Chem Phys (2018) 20, 1872-1880
2016
*Watanabe, R., Soga, N., Hara, M., & *Noji, H.“Arrayed water-in-oil droplet bilayers for membrane transport analysis”
Lab Chip (2016) 16, 3043-3048
*Watanabe, R., Soga, N., & *Noji, H.
“Novel nano-device to measure voltage-driven membrane transporter activity”
IEEE Trans Nanotechnol (2016) 15, 70-73
*McMiillan, D. G., Watanabe, R., Ueno, H., Cook, G. M., & *Noji, H.
“Biophysical Characterization of a Thermoalkaliphilic Molecular Motor with a High Stepping-Torque Gives Insight into Evolutionary ATP Synthase Adaptation”
J Biol Chem (2016) 291, 23965-23977
2015
Li, C. B., Ueno, H., Watanabe, R., Noji, H., & *Komatsuzaki, T.“ATP hydrolysis assists Phosphate release and promotes reaction ordering in F1-ATPase”
Nat Commun (2015) 6, 10223
Soga, N., *Watanabe, R., & *Noji, H.
“Attolitre-sized lipid bilayer chamber array for rapid detection of single transporters”
Sci Rep (2015) 5, 11025
Watanabe, R., Koyasu, K., You, H., Tanigawara, M., & *Noji, H.
“Torque transmission mechanism via DELSEED loop of F1-ATPase”
Biophys J (2015) 108, 1144-52
Yukawa, A., *Watanabe, R., & *Noji, H.
“Effects of an ATP analogue, adenosine 5'-[α-thio]triphosphate, on F1-ATPase rotary catalysis, torque generation, and inhibited intermediated formation”
Biochem Biophys Res Commun (2015) 458, 515-9
Yukawa, A., Iino, R., Watanabe, R., Hayashi, H., & *Noji, H.
“Key Chemical Factors of Arginine Finger Catalysis of F1-ATPase Clarified by an Unnatural Amino Acid Mutation”
Biochemistry (2015) 54, 472-80
2014
*Watanabe, R., Soga, N., Yamanaka, T., & *Noji, H.“High-throughput formation of lipid bilayer membrane arrays with an asymmetric lipid composition”
Sci Rep (2014) 4, 7076
Watanabe, R., Minagawa, Y., & *Noji, H.
“Thermodynamic analysis of F1-ATPase rotary catalysis using high-speed imaging”
Protein Sci (2014) 23, 1773-1779
*Watanabe, R., Soga, N., Fujita, D., Tabata, K. V., Yamauchi, L., Kim, SH., Asanuma, D., Kamiya, M., Urano, Y., *Suga, H., & *Noji, H.
“Arrayed lipid bilayer chambers allow single-molecule analysis of membrane transporter activity”
Nat Commun (2014b) 5, 4519
Watanabe, R., Matsukage, Y., Yukawa, A., Tabata, K. V., & *Noji, H.
“Robustness of the Rotary Catalysis Mechanism of F1-ATPase”
J Biol Chem (2014) 289, 19331-19340
Arai, HC., Yukawa, A., Iwatate, RJ., Kamiya, M., Watanabe, R., Urano, Y., & *Noji, H.
“Torque generation mechanism of F1-ATPase upon NTP binding”
Biophys J (2014) 107, 156-64
Watanabe, R., & *Noji, H.
“Characterization of the temperature-sensitive reaction of F1-ATPase by using single-molecule manipulation”
Sci Rep (2014) 4, 4962
Watanabe, R., & *Noji, H.
“Timing of inorganic phosphate release modulates the catalytic activity of ATP-driven rotary motor protein”
Nat Commun (2014a) 5, 3486
2013
Watanabe, R., Hayashi, K., Ueno, H., & *Noji, H.“Catalysis-enhancement via rotary fluctuation of F1-ATPase”
Biophys J (2013) 105, 2385-91
Watanabe, R., Tabata, KV., Iino, R., Ueno, H., Iwamoto, M., Oiki, S., & *Noji, H.
“Biased Brownian stepping rotation of FoF1-ATP synthase driven by proton motive force”
Nat Commun (2013) 4, 1631
2012
Tanigawara, M., Tabata, KV., Ito, Y., Ito, J., Watanabe, R., Ueno, H., Ikeguchi, M., & *Noji, H.“Role of the DELSEED Loop in Torque Transmission of F1-ATPase”
Biophys J (2012) 103, 970-8
You, H., Iino, R., Watanabe, R., & *Noji, H.
“Winding single-molecule double-stranded DNA on a nanometer-sized reel”
Nucleic Acids Res (2012) 40, e151
Watanabe, R., Okuno, D. Sakakihara, S. Shimabukuro, K. Iino, R. Yoshida, M. & *Noji, H.
“Mechanical modulation of catalytic power on F1-ATPase”
Nat Chem Biol (2012) 1, 86-92
2010
Watanabe, R., Iino, R. & *Noji, H.“Phosphate release in F1-ATPase catalytic cycle follows ADP release.”
Nat Chem Biol (2010) 6, 814-20
2009
Enoki, S., Watanabe, R., Iino, R. & *Noji, H.“Single-molecule study on the temperature-sensitive reaction of F1-ATPase with a hybrid F1 carrying a single beta(E190D).”
J Biol Chem (2009) 284, 23169-76
2008
Watanabe, R., Iino, R., Shimabukuro, K., Yoshida, M. & *Noji, H.“Temperature-sensitive reaction intermediate of F1-ATPase.”
EMBO Rep (2008) 9, 84-90
2024
蛍光観察装置出願国:日本.出願番号:特願2024-051018
発明者:渡邉力也, 飯田龍也
2022
標的核酸の検出方法及びキット出願国:日本.出願番号:特願2022-188381
発明者:渡邉力也,篠田肇, 牧野麻美, 吉村麻実
蛍光検出装置
出願国:日本.出願番号:特願2022-160919
発明者:高橋泰啓,冨岡安,渡邉力也,安藤潤,篠田肇
マイクロデバイス用のペプチド結合加水分解酵素検出用蛍光プローブ
出願国:日本.出願番号:特願2022-79082
発明者:浦野泰照,小松徹,鏡味優,坂本眞伍,笠井貴文,渡邉力也
複数種類の標的核酸断片を検出する方法及びキット
出願国:日本.出願番号:特願2022-064650
発明者:渡邉力也, 篠田肇, 牧野麻美, 飯田龍也, 吉村麻実
2021
一本鎖RNA精製法出願国:日本.出願番号:特願2021-204628
発明者:渡邉力也, 篠田肇, 西増弘志, 石川潤一郎
酵素の測定方法、マイクロチャンバーアレイ、キット、及び目的分子の測定方法
出願国:日本.出願番号:特願2021-199642
発明者:安藤潤, 渡邉力也
固相抽出を利用した蛍光プローブライブラリの調製方法、及びこれを用いた酵素活性計測方法
出願国:日本.出願番号:特願2021-96839
発明者:小松徹, 浦野康照, 坂本眞伍, 渡邉力也
2020
標的核酸断片の検出方法及びキット出願国:日本.出願番号:特願2020-219481
発明者:渡邉力也, 篠田肇, 牧野麻美
生体分子の濃縮・検出方法及びキット
出願国:日本.出願番号:特願2020-169092
発明者:渡邉力也, 篠田肇, 牧野麻美
2019
標的核酸断片の検出方法及びキット出願国:日本.出願番号:特願2019-125564
発明者:渡邉力也, 西増弘志, 濡木理
ENPP ACTIVITY DETECTION USING MICRO DEVICE
出願国:USA.出願番号:62/858,388
発明者:浦野康照, 小松徹, 坂本眞伍, 野地博行, 中川秀彦, 川口充康, 渡邉力也
2018
マイクロリアクタチップ上での濃度勾配形成方法およびマイクロリアクタチップ出願国:日本.出願番号:特願2018-84809
発明者:渡邉力也, 野地博行
2017
脂質膜小胞の形成方法およびマイクロリアクタチップ出願国:日本.出願番号:特願2017-131882
発明者:曽我直樹, 渡邉力也, 野地博行
マイクロリアクタチップおよびその製造方法
出願国:日本.登録番号:特許6844873
発明者:渡邉力也, 曽我直樹, 野地博行
2015
脂質膜非透過性指示薬出願国:日本.登録番号:特許6772422
発明者:渡邉力也, 大舘真也, 曽我直樹, 野地博行
高密度微小チャンバーアレイおよびこれを用いた測定方法
出願国:日本.登録番号:特許6607936
発明者:渡邉力也, 曽我直樹, 野地博行
2013
高密度微小チャンバーアレイおよびその製造方法出願国:日本.登録番号:特許6281834
発明者:渡邉力也, 藤田大士, 菅裕明, 野地博行
2024
ウイルス遺伝子検査装置 世界最速で小型軽量 理研など化学工業日報 2024年9月24日 朝刊7面
小型・低コストで多種ウイルス検出 理研が遺伝子検査装置開発
科学新聞 2024年9月20日 朝刊1面
2023
複数ウイルス、15分で検出 理研が技術、コロナでも検証へ日経産業新聞 2023年6月15日 朝刊7面
2022
コロナウイルス 3分で検出 理研など装置開発読売新聞 2022年12月4日 朝刊29面
3分で新型コロナ感染判定
日経産業新聞 2022年11月28日 朝刊7面
9分以内にコロナ検出 診断装置を開発 理研など
朝日新聞 2022年7月6日 朝刊20面
「PCR以上の感度」新型コロナウイルスを早く安く正確に診断
科学新聞 2022年6月3日 朝刊1面
コロナ迅速・高感度判定 理研、東大など
化学工業日報 2022年6月2日 朝刊5面
感染判定全自動で9分 理研など新装置開発
毎日新聞 2022年5月31日 朝刊23面
コロナ「9分で検出」装置 理研など開発
読売新聞 2022年5月30日 朝刊2面
コロナ検出9分以内で 理研など、装置開発
日本経済新聞 2022年5月27日 朝刊38面
新型コロナ9分で検出 理研など、全自動装置
日刊工業新聞 2022年5月27日 朝刊25面
コロナ9分で自動検出 理研などが開発
東京新聞 2022年5月27日 朝刊3面
9分で新型コロナを判定 新たな装置とは?
日本テレビ 2022年5月27日 ZIP
新型コロナウイルス全自動検出装置
NHK 2022年5月26日 ニュース7, ニュースウォッチ9など
理研9分でコロナ判定の装置開発
TBS 2022年5月26日 News23, THE TIMEなど
コロナ陽性を「9分」で判定
テレビ朝日 2022年5月26日 報道ステーションなど
理研「変異株にも対応」9分でコロナ判定全自動装置開発
フジテレビ 2022年5月26日 FNN Live Newsなど
2021
PCR並み検査 5分で日本経済新聞 2021年11月19日 朝刊17面
感染5分で判明。理研など新検査技術
読売新聞 2021年4月20日 朝刊30面
新型コロナ検査5分以内で結果
朝日新聞 2021年4月20日 夕刊8面
コロナ判定5分で。理研チーム開発 蛍光分子利用
毎日新聞 2021年4月20日 夕刊7面
新型コロナ5分で検出 理研など半導体製造技術を応用
日本経済新聞 2021年4月20日 朝刊13面
コロナ感染5分で判定 理研2年で実用化へ
産経新聞 2021年4月20日 朝刊23面
新型コロナ由来ウイルスRNA5分以内に検出。理研など半導体プロセス活用
日刊工業新聞 2021年4月20日 朝刊26面
理研-東大 前処理なし5踏んでコロナ検査
化学工業日報 2021年4月20日 朝刊6面
新型コロナ5分以内に検出 理研・東大などが検査法開発
NHK 2021年4月19日 シブ5時
5分以内でコロナ感染判定
TBS 2021年4月19日 Nスタ、News23
5分で陽性判明!理研の最新研究
テレビ朝日 2021年4月19日 スーパーJチャンネル
コロナ検出5分。理研X東大 最新技術
フジテレビ 2021年4月19日 It
2020
血中酵素の変異 高感度検出日経産業新聞 2020年3月23日
疾患に関与する血中酵素 活性異常を1分子で解析
科学新聞 2020年3月20日
2019
理研の最前線 開拓研究本部 渡邉分子生理学研究室 細胞膜で生命活動解明日刊工業新聞 2019年11月4日
2018
膜タンパク質の脂質輸送過程を高感度計測科学新聞 2018年3月23日
1分子ごとに高感度観察 東大など
日経産業新聞 2018年3月9日
2014
未来の起源:渡邉力也TBS 2014年12月21日
細胞膜再現し観察 - 東大がん化の仕組み解明に光
日経産業新聞 2014年11月19日
非対称性の人工生体膜 - 東大が量産技術 薬効などチップ計測に道
日刊工業新聞 2014年11月18日
東大グループ 膜輸送の超高感度計測に成功
薬事日報 2014年8月2日
毎秒30個のイオン透過、東大膜たんぱく質観察
日経産業新聞 2014年8月15日
東大、膜輸送体の輸送活性超高感度計測に成功
科学新聞 2014年8月1日
東大、細胞膜輸送体の活性度を高感度に計測する技術開発
日刊工業新聞 2014年7月29日
2011
回転分子モーターのエネルギー変換機構日経産業新聞 2011年12月2日
2010
ATP合成、仕組み解明日経産業新聞 2010年10月20日